参照元に\ref{ラベル}を記述し、参照先の数式の後ろに、\label{ラベル}をいれます。ラベルは適当な文字列です。
equation \ref{EQU} \begin{equation} \int f(x)dx=\int g(y)dy \label{EQU} \end{equation}
これに限らず、LaTeXで参照コマンドを使用する場合は、platexコマンドを2会実行する必要があります。
関連 : 参考文献
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